Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms