Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AFDNP55196 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFDNP55196 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms