Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRISP1P54107 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRISP1P54107 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms