Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMTNP53814 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMTNP53814 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMTNP53814 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMTNP53814 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMTNP53814 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMTNP53814 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms