Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms