Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP98P52948 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP98P52948 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP98P52948 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP98P52948 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP98P52948 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms