Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLK1P49759 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLK1P49759 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLK1P49759 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms