Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TTPAP49638 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TTPAP49638 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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