Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDO2P48775 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDO2P48775 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDO2P48775 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDO2P48775 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TDO2P48775 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDO2P48775 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms