Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms