Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCAMP43121 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCAMP43121 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCAMP43121 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCAMP43121 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCAMP43121 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCAMP43121 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCAMP43121 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms