Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPOP42166 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPOP42166 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPOP42166 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms