Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJC1P36383 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJC1P36383 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJC1P36383 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJC1P36383 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms