Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms