Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN2P35609 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN2P35609 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms