Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms