Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF2P35240 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF2P35240 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF2P35240 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF2P35240 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF2P35240 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NF2P35240 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NF2P35240 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NF2P35240 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NF2P35240 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NF2P35240 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NF2P35240 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NF2P35240 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NF2P35240 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NF2P35240 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NF2P35240 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms