Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCC1P33527 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms