Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG3P32926 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG3P32926 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG3P32926 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSG3P32926 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms