Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA1P29973 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms