Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms