Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD10P28358 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms