Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms