Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMB4P28070 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms