Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD53P19397 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD53P19397 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD53P19397 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms