Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2A2P16615 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms