Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms