Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREB1P16220 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREB1P16220 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREB1P16220 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREB1P16220 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREB1P16220 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms