Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSP16219 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSP16219 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSP16219 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSP16219 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms