Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF2P15336 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF2P15336 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF2P15336 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF2P15336 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms