Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms