Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms