Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms