Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms