Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A1P11836 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms