Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms