Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms