Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD2P0DJD1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms