Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4BP0C0L5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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