Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms