Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A4P08684 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A4P08684 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms