Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT18P05783 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT18P05783 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT18P05783 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT18P05783 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT18P05783 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT18P05783 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT18P05783 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT18P05783 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT18P05783 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms