Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APODP05090 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APODP05090 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APODP05090 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APODP05090 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APODP05090 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APODP05090 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APODP05090 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APODP05090 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APODP05090 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APODP05090 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APODP05090 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms