Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC3P02656 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms