Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNB1P01574 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms