Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFRP00533 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFRP00533 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFRP00533 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFRP00533 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFRP00533 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms