Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3O95983 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD3O95983 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms