Protein–RNA interactions for Protein: O95936

EOMES, Eomesodermin homolog, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EOMESO95936 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EOMESO95936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EOMESO95936 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EOMESO95936 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EOMESO95936 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EOMESO95936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EOMESO95936 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EOMESO95936 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms