Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms