Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNIH1O95406 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH1O95406 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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